公司税务处理程序通常包括以下几个步骤：
账务核查与调整
对公司的存货进行全面盘点，确保账面记录与实物库存一致。
处置固定资产时，依法缴纳相关税费，如增值税、所得税等。
全面梳理公司的债权债务情况，包括应收款项、应付款项等。对于无法收回的债权，按规定计提坏账准备；对于无法支付的债务，进行债务重组或按法定程序处理。确保债权债务清理过程中的账务调整准确无误，避免遗漏或错误。
税务处理与申报
对未抵扣的进项税额进行核查，并按税法规定进行转出处理。
根据存货和固定资产的处置情况，计算并缴纳应纳增值税。确保所有增值税相关账务调整正确，避免税务风险。
在注销前进行企业所得税清算，计算清算所得。清算所得包括企业全部资产的可变现价值或交易价格，扣除资产净值、清算费用及相关税费后的余额。根据清算所得向税务机关申报并缴纳企业所得税。
税务登记与报到
新公司自领取营业执照之日起三十日内，持有关证件，向当地税务机关申报办理税务登记。具体流程包括领表、填表、报送税务登记表，并提供相关资料如营业执照副本、组织机构代码证、法定代表人身份证、银行账户证明等。
公司成立后，需要按照规定的时间向税务机关报到，包括国税和地税的报到。报到后，需办理网上扣税手续，并核定缴纳何种税种。
税务注销
在公司解散或注销前，需进行税务注销手续，包括结清税款、滞纳金和罚款，缴销发票和税务登记证。同时，还需要向工商行政管理部门提交注销申请，并进行注销公告。
注销公司的银行账户，并将账户中的资金进行合理安排。
其他相关事项
在税务处理过程中，若涉及税务争议，需按照《中华人民共和国税收征收管理法》等相关法律法规进行处理，包括申请行政复议或直接提起诉讼。
若公司税务登记内容发生变化，如住所或经营地点变动，需办理税务变更登记，包括提交变更申请、填写相关表格并提供必要资料。
以上步骤构成了公司税务处理的基本流程，具体操作时可能因地区和具体情况有所不同，建议咨询当地税务机关或专业税务顾问以获取详细指导。