新汽车刷程序存在以下危害：
燃油需求增加：
刷程序后，车辆可能需要使用更高品质的燃油，如从92号汽油升级到95号汽油，这不仅增加了燃油成本，还可能对发动机的运行效率提出更高要求。
发动机超频运转：
为了适应新程序，发动机可能需要进行超频运转，这会对冷却系统产生更大的依赖。如果冷却系统没有相应升级，可能会导致发动机过热，进而影响其耐久性和车辆寿命。
冷却系统压力增加：
超频运转的发动机需要更精确的温度控制，对冷却系统的依赖性显著增强。如果冷却系统不足或维护不当，可能会导致发动机温度过高，从而对车辆造成不可逆的损害。
法律和保障挑战：
4S店通常不会为非法或非官方程序引起的车辆问题提供质保。这意味着刷程序的车辆在出现故障时，车主可能需要自掏腰包进行维修，增加了维护成本和风险。
养车成本增加：
刷程序可能导致车辆需要更频繁的维护和更换零部件，从而增加养车成本。
发动机寿命缩短：
刷程序可能会牺牲发动机的可靠性、耐用性和使用寿命，以追求更高的功率。
保修失效：
刷程序可能会导致车辆的保修失效，特别是在保修期内进行刷程序的情况下。
年检困难：
刷程序的车辆在年检时可能会遇到困难，需要额外支付费用才能通过。
综上所述，尽管刷程序可能带来短暂的性能提升，但其潜在危害和风险也不容忽视。车主在考虑刷程序时，应权衡利弊，确保在合法和安全的前提下进行，并充分了解可能带来的经济和维修风险。