深圳入户调查程序主要包括以下几个步骤：
申请审核
申请人需要提交有关单位或个人的身份证明、户口本、居住证等有效证明文件，向社区提出申请。
社区审核
社区会组织专业人士对申请人的资料进行审核，并组织当地居民进行调查，以确保申请人的合法性。
街道审核
社区审核通过后，街道将会对申请人的材料进行审核，确认申请人符合入户条件。
区审核
街道审核通过后，申请人的资料将会被转交给区政府，由区政府进行审核。
市审核
区政府审核通过后，申请人的资料将被转交给市政府，由市政府进行最终审核。
公示
审核通过后，市政府会将申请人的信息公布在官方网站，允许市民提出异议。
办理入户手续
审核通过后，申请人或被投靠人需要携带申请材料原件及复印件，预约前往被投靠人户籍地公安分局户政窗口办理。若现场审核通过，不同户籍将会有不同情况，分别处理。
缴纳费用
审核通过后，办理者需要按照规定缴纳相应的费用。
领取入户资格证书
完成上述步骤后，办理者可以在当地政府有关部门领取入户资格证书，用以证明自己已经成功办理了入户手续。
建议申请人在办理深圳入户时，提前准备好所有必需的材料，并按照上述流程逐步操作，以确保顺利完成入户手续。