小程序不能代替App的原因主要有以下几点：
功能残缺
小程序基于微信平台，功能上受到限制，无法实现许多App可以轻松完成的功能。例如，复杂的业务逻辑、大型交互、游戏等。
小程序的代码量有限制，例如微信规定小程序的代码不能超过2M，这限制了小程序的功能和UI的精细度。
场景限制
小程序本质上是Web应用，需要网络连接才能使用，没有网络或网络不稳定时功能受限。而App可以在没有网络的情况下继续运行，使用本地缓存。
小程序依赖于第三方App（如微信、支付宝、百度等），而App可以独立运行，不依赖其他平台。
体验和自主性
小程序的体验相对简单，适合需要快速、轻量级服务的用户。但对于需要复杂功能和个性化设置的用户来说，App提供了更高的自主性和灵活性。
App内部的功能和内容由运营者全权把控，而小程序受到微信平台的诸多限制，例如流量获取和营销策略。
开发自由度和成本
小程序的开发自由度较低，受限于微信平台的技术框架和API支持。而App开发可以更灵活地实现各种功能，不受第三方平台限制。
小程序的开发成本相对较低，工期短，适合快速迭代和轻量级项目。但对于需要复杂功能和大规模业务逻辑的项目，App开发更为合适。
综上所述，虽然小程序具有无需安装、跨平台等优点，但由于功能残缺、场景限制、体验和自主性不足以及开发自由度和成本等方面的限制，小程序无法完全取代App。