在京东小程序发货时，选择快递公司的依据主要是商品类型、配送需求以及成本考虑。以下是具体的建议：
京东自营商品
通常由京东快递配送，配送范围在京东自营配送范围内的一般1-3天可以到达。
对于大件家电等特别重的商品，会有专门的配送服务。
京东商城商品
配送方式取决于商家，一般默认发圆通、申通、韵达等快递公司。
偏远地区可能会转发EMS快递。
第三方商家发货
可以选择市面上所有的快递公司，如圆通、韵达、申通、中通等。
部分与京东有深入合作的商家可能会由京东代为配送。
特殊配送需求
对于冷链生鲜等特定商品，京东提供专门的物流服务。
如果需要快速配送，可以选择京东快递的加急服务，如次日达、夜间配等。
建议
自营商品：优先选择京东快递，确保快速且可靠的配送。
商城商品：根据商家提供的默认快递进行选择，如果对配送时间有更高要求，可以考虑其他快递公司的服务。
第三方商家：可以根据自己的需求和习惯选择熟悉的快递公司。
通过以上信息，可以根据自己的具体需求和情况，选择最适合的快递服务。