在法院程序中申请亲子鉴定，通常需要遵循以下步骤：
人员准备
被鉴定人应由成年父亲（或父母）和儿子组成，如果涉及父母双方，则双方都应参与鉴定。
成年被鉴定人应当亲自同意鉴定，12岁以上的青少年应适当征求其对鉴定的意见。
提供身份证明
当事人需提供身份证、孩子的出生证（或户口）等证明身份及其相互关系的证件的原件及复印件。
办理委托手续
当事人可以通过法院、律师事务所或相关部门办理委托手续，也可以直接个人委托进行司法鉴定。
缴费采样
所有被鉴定人都必须亲自到现场，由专业人员进行取样，并留下指纹及拍摄照片作身份证明。取样时需有合法证人在场。
实施鉴定
在核对当事人身份及委托书后，开始实验室鉴定。
结果反馈
出具鉴定结果报告，并由委托者本人签收。鉴定报告书仅向委托人本人发送收据。
法律依据
亲子鉴定属于司法鉴定，司法鉴定是指在诉讼活动中鉴定人运用科学技术或者专门知识对诉讼涉及的专门性问题进行鉴别和判断并提供鉴定意见的活动。
其他注意事项
在离婚诉讼中，如果想要通过法院来启动亲子鉴定的程序，应当提供初步的证据，如对方在受孕前存在出轨情形等。即使对方不同意亲子鉴定，法院也可依据证据链的完整程度来判定亲子关系是否成立。
以上步骤是根据现行的法律规定和操作规程进行的，旨在确保亲子鉴定的合法性和准确性。在进行亲子鉴定时，当事人应当按照这些程序行事，并提供必要的身份证明和其他文件，以确保鉴定的有效性和合法性。