微信小程序虽然具有许多优点和功能，但也存在一些局限性，以下是一些主要的缺点：
平台限制
微信小程序只能在微信平台上运行，无法在其他平台或应用商店上使用，这限制了小程序的曝光和用户获取渠道。
功能限制
微信小程序相对于原生应用来说，功能上有一定的限制。尽管微信不断扩展小程序的功能，但与原生应用相比，小程序在某些方面的功能和性能还是有所限制。
开发限制
开发微信小程序需要使用微信提供的开发工具和API，开发者在某些方面的灵活性和自由度相对较低。同时，小程序开发需要熟悉微信小程序开发规范和技术要求，相对于传统的Web开发或原生应用开发有一定的学习成本。
用户获取难度
由于微信小程序只能在微信平台内运行，因此对于新用户的获取和引流相对困难。需要借助其他渠道或推广手段来吸引用户进入小程序。
用户留存和复购
微信小程序的留存和复购率相对较低。由于用户在微信中有众多其他的应用和服务可选择，他们可能会更容易流失或转向其他应用。
数据控制
微信小程序中的用户数据和运营数据受限于微信平台的控制和规范。开发者对于用户数据的自由度和灵活性较低。
审核和版本控制
发布和更新小程序需要经过微信的审核，审核流程可能需要一定的时间。此外，微信平台对小程序的版本控制较为严格，开发者需要遵守一些规定和限制。
设计自由度受限
微信小程序的设计需要遵循微信的设计规范和限制，以确保统一的用户体验。这可能会限制开发者在设计方面的自由度和创意表达。
依赖微信生态系统
微信小程序必须在微信平台上运行，用户需要在微信中打开小程序。这意味着小程序的可见性和用户获取主要依赖于微信的推荐和分享，而无法独立于微信平台存在。
技术限制
小程序不支持某些成熟的技术，例如3D渲染和webgl，这限制了其在某些高级功能方面的应用。
入口和分享限制
小程序没有自己的入口，也无法直接分享到朋友圈，这限制了它的传播和用户获取。
数据接口和服务器要求
小程序的数据接口服务器必须支持HTTPS，这虽然提高了安全性，但也增加了成本。
设备功能限制
小程序对于某些设备和系统功能的访问受到限制，例如访问通讯录、传感器、摄像头等功能可能会受到限制，这可能会限制某些特定场景的应用开发。
个人开发者限制
个人小程序在功能、类目、数据分析和数量等方面都有较多的限制，例如个人用户只能创建一个个人小程序，且每个小程序只能关联一个微信公众号。
这些局限性使得微信小程序在功能、用户获取、数据控制和开发灵活性等方面存在一些不足，开发者需要充分考虑这些因素，以确保小程序的顺利开发和运营。