调解程序不合法是指 在调解过程中，调解活动没有遵循法律规定的程序，或者调解协议的内容违反了法律规定。具体来说，调解程序不合法可能包括以下几种情况：
适用特别程序、督促程序、公示催告程序、企业法人破产的还债程序的案件，这些案件依法不适宜进行调解。
严重违法以及犯罪行为导致需要给予严厉制裁的民事、经济案件，这些案件依法应当严格依法进行，不适宜通过调解解决。
确认之诉案件，例如确认合同无效的案件，这类案件依法应当通过判决而不是调解解决。
涉及行政性因素的案件，这类案件依法应当通过行政途径解决，不适宜进行调解。
以票据、其他流通证券为诉讼标的的案件，这类案件依法应当通过专门的程序解决，不适宜进行调解。
性质上不适宜用调解的案件，例如以当事人无处分权为标的的案件，当事人未出庭，委托代理人无调解授权的案件，以及须公开审理的案件等。
调解协议违反法律、法规的禁止性规定，例如规避法律的强制性规定，非法转移财产所有权等。
纠纷当事人遗漏或者不适格，如在继承纠纷中遗漏了继承人或把没有继承权的人列为当事人。
随意启动调解程序，如法院调解没有独立的程序，法官可以随时组织当事人调解，启动调解程序的随意性较大，侵犯了当事人的诉讼权利。
综上所述，调解程序不合法不仅可能体现在程序上的违规，还可能体现在实体内容上的违法。为了确保调解的合法性和公正性，调解活动必须严格遵守法律规定，保障当事人的合法权益，并遵循法定的程序。