复杂的病毒程序主要包括以下几种：
多态病毒：
每次感染都会发生变异，使其特征码难以检测。
寄生病毒：
附着在可执行文件上，并在受感染的宿主程序运行时进行复制。
驻留内存病毒：
将自身作为驻留系统程序的一部分驻留在内存中，感染每一个运行在内存中的程序。
引导扇区病毒：
感染主引导扇区或引导扇区，当系统从受感染的磁盘引导时进行传播。
宏病毒：
利用宏语言编写，能够在用户打开受感染的文件时执行恶意代码。
这些病毒程序通过不同的机制传播和感染系统，具有隐蔽性和破坏性。建议定期更新杀毒软件，并谨慎处理未知来源的文件和邮件，以防范这些复杂病毒程序的攻击。