PLC程序混乱可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因及建议：
线路问题
线路过长：导致信号干扰，建议使用屏蔽线联接变频器，并与动力线分开布线。如果实在做不到，可以在PLC输出一个中继，中继放在变频器边上，再联上变频器，实现电气隔离。
接线有误：确保主机电源接线端子相线连接正确，避免主机不能启动或程序丢失。
干扰问题
内部干扰：PLC内部元件或电路设计可能引起干扰，建议定期对PLC机架插槽接口处进行吹扫，清除灰尘。
外部干扰：外部环境中的电气噪声、电磁干扰或电源波动等因素可能影响PLC程序的稳定性，建议采取抗干扰措施，如使用屏蔽线、滤波器等。
接地问题
接地不良：PLC主机及模块必须有良好的接地，确保I/O模块24V直流电源负极有良好的接地。接地不良可能导致程序混乱或功能故障。
操作问题
操作失误：在使用编程器查找故障时，应先断开主机电源，再断开I/O模块电源，避免断电处理间存入不正确数值而造成程序混乱。
软件问题
编程错误：在编写PLC程序时，可能出现逻辑错误、语法错误或不合理的算法设计等问题，导致程序无法正常运行。
软件故障：PLC软件本身可能存在缺陷或漏洞，导致程序异常或崩溃。
硬件问题
存储器损坏：PLC存储器损坏可能导致程序无法正常运行或数据丢失。
处理器故障：PLC处理器故障也可能导致程序异常。
电源故障：PLC电源故障可能导致程序无法正常运行。
其他问题
周期性死机：PLC周期性死机可能是由于机体长期积灰造成，建议定期进行吹扫。
输出线圈重复利用：PLC在循环扫描过程中可能未执行部分程序，导致线圈重复利用，建议检查程序逻辑，避免线圈重复利用。
综上所述，PLC程序混乱可能由线路问题、干扰问题、接地问题、操作问题、软件问题、硬件问题等多种原因引起。建议逐一排查这些可能的原因，并采取相应的解决措施。