阉鸡的防疫程序包括以下几个关键步骤：
前期准备
在出栏后3-5日内彻底清洗栏舍和用具，并用消毒剂喷洒和浸泡消毒。舍外场地用生石灰粉泼洒消毒，以保持鸡舍周边长期处于白色状态。
防疫注射
阉割前几天，完成必要的防疫注射和驱虫工作。建议将每300只鸡划分为一群，按每平方米10只阉鸡计算所需面积，确保运动场宽阔、无污染，并提前三天在饲料中加入维生素K3，每千克鸡重添加5毫克，以加强凝血功能，提高抵抗力。
疫苗免疫
从1日龄到120日龄，分阶段注射不同活苗。具体免疫程序如下：
1日龄至120日龄：注射不同活苗，二联活苗，确保在阉鸡进行外科手术摘除睾丸前，鸡群处于有效高抗体水平及健康状态，控制外科手术应激引起的死亡，提高成活率。
120日龄：再次注射不同活苗，二联活苗，进一步巩固免疫力，确保鸡群健康上市。
阉割前后注意事项
阉鸡前5天打一针防呼吸道的针，使用利高霉素等药物进行防治，确保呼吸道健康。
阉割前观察鸡群健康状况，如呼吸道轻重、采食量大小、弱鸡比例、鸡群粪便等，如有异常则暂停阉鸡，避免继发感染。
阉割完后，让小鸡能喝上水，停料5个小时，防止伤口不易愈合，合理控制饮水，采取少喂勤添，逐步过渡。
饲养管理
提供给阉鸡的运动场要宽阔，无污染，有青草植被的荒丘地或林果地，方便管理。
阉鸡前后，在饲料中添加维生素K3和多维，抗应激，提高机体抵抗力。
阉鸡前一晚，鸡群禁止喂食，但要保证充足饮水，并进行分栏，便于阉鸡时抓鸡和更换新垫料，防止伤口感染。
通过以上防疫程序，可以有效降低阉鸡在饲养过程中的疾病发生率，提高成活率，确保鸡群健康上市。