农村小区开发的程序包括以下几个主要步骤：
确定开发项目
农村集体经济组织或个人根据自身情况，确定合适的土地开发项目，并与相关部门进行沟通和协商，确定项目的可行性。
土地征收
如果需要征收土地，农村集体经济组织或个人需向当地政府申请土地征收，并与被征收的村民进行协商和赔偿。
土地规划
根据项目的特点和需要，制定土地规划方案，并向当地政府申请土地规划许可证。
项目建设
根据土地规划方案，农村集体经济组织或个人进行项目建设，包括基础设施建设、房屋建设、道路建设等。
环评审批
根据国家相关法规，对环境影响进行评估和审批，并根据审批意见进行必要的环保措施。
用地审批
根据国家相关法规，向当地政府申请用地审批，并获得相应的用地证书。
办理手续
根据相关法规，办理建设工程规划许可证、施工许可证、竣工验收等手续。
运营管理
项目建设完成后，进行运营管理，包括物业管理、租赁管理、销售管理等。
此外，农村建房还需要遵循以下具体审批程序：
提交申请
向村委会提交建房申请，说明建房目的和建设地点。
初审
村委会对申请进行初步审核，确认是否符合村庄规划和土地使用规定。
上报乡镇
村委会将审核通过的申请上报乡镇政府或乡建办。
乡镇审核
乡镇政府或乡建办对申请进行审核，可能涉及土地使用、规划调整等方面。
县级审批
乡镇审核通过后，将申请报送县国土资源局或县规划建设局。
规划审批
县级规划部门对建设规划进行审查，确保建设项目符合规划要求。
发放许可
各级审批部门确认无误后，发放建设许可证，允许建房。
建议：
在进行农村小区开发时，应详细规划并严格按照相关法规进行审批，确保项目的合法性和可行性。
与当地政府和相关部门保持良好沟通，及时解决开发过程中遇到的问题。