组织运行是指 组织实现自身目标和发挥自身功能的过程。这个过程涉及到组织结构的动态化、组织制度的建立、组织冲突的协调、运行机制的健全以及运行过程的调控等多个方面。组织运行一般经过投入、实施过程和产出三个步骤，包括决策、实施和产出三个环节。
在编程中，运行程序则是指将编写好的代码转化为可执行的计算机程序，并在计算机上执行的过程。这个过程包括编译、加载和执行等步骤。
总结来说，组织运行侧重于组织的整体运作和内部机制，而运行程序则侧重于计算机代码的执行过程。两者在概念和应用上有明显的区别，但都涉及到从制定到实施再到产出的过程。