办理留置程序的流程一般包括以下几个步骤：
立案审批
监察机关对涉嫌职务违法犯罪行为进行初步核实后，认为需要立案调查的，依法履行立案审批程序。
决定留置
经监察机关依法审批，可以将被调查人留置在特定场所。留置应当符合法定的适用情形，例如涉及案情重大、复杂等情况。
调查取证
在留置期间，调查人员会对被留置人员进行讯问，获取其供述和辩解等言词证据。
全面收集其他相关证据，包括书证、物证、证人证言等，以查明案件事实。
保障被留置人权利
监察机关要保障被留置人的饮食、休息和安全等基本权利，同时要按照规定安排会见律师等提供法律帮助等相关事宜。
案件审查
调查终结后形成调查报告，移送审查起诉部门，由相关部门进行审查，根据审查结果作出相应的处理决定，如提起公诉等。
解除留置
调查终结后，发现不应当采取留置措施的，应当及时解除。
具体流程细节可能因地区和具体情况有所不同，但大致步骤如上所述。在整个过程中，监察机关需严格遵循法律规定，确保留置措施的合法性和正当性，并充分保障被留置人员的合法权益。