宝马刷程序卡可能由以下原因导致：
程序不兼容：
刷入的程序可能与车辆本身不兼容，导致程序无法正常运行或引发故障码。
硬件问题：
车辆原有的硬件部件可能存在小毛病，刷程序后这些问题可能更明显地暴露出来，从而引发故障码。
操作不当：
车主在刷程序时可能操作不规范，导致程序无法正确写入或运行。
盲目换零件：
有些车主在刷程序时可能会盲目更换零件，而这些零件可能与程序不兼容，从而引发故障码。
综上所述，宝马刷程序卡的原因可能涉及程序兼容性、硬件问题、操作不当以及盲目换零件等多个方面。建议车主在进行刷程序前，务必选择专业的改装店或技术人员，并进行充分的测试和评估，以确保刷程序的安全和有效性。