活佛转世的程序通常包括以下几个步骤：
寻访灵童
在前世活佛去世一年后，由主寺僧官执行寻访任务。首先通过打卦或请护法神降神来确定灵童的出生方向、路程及地方特征等，然后分路寻访。寻访结果可能找到一位或多位灵童。
辨认器物
取前世活佛生前常用的器物，再取相同形状和数量的其他器物，真伪相杂，让灵童辨认。如果灵童抓到的是真物，则该灵童为活佛转世。
降神询问
由主寺请护法神降神，询问哪一个灵童是前世活佛转世，并请神降谕。如果护法神的答复与辨认器物的结果一致，则该灵童成为候选灵童。
金瓶掣签
如果找到多位候选灵童，则将他们的名字写在象牙签上，放入金瓶中，由皇帝派员监督抽签掣定。金瓶掣签是藏传佛教活佛转世制度中最为关键的一环，体现了宗教的神圣性和中央政府对活佛转世事务的管理和尊重。
批准继位
金瓶掣签的结果报请皇帝批准，该灵童即可继承活佛的相应名号。这一过程需要经过不同级别的政府宗教事务部门的审批，并在有特别重大影响的情况下，报国务院批准。
培养与认定
一旦转世灵童被认定，他们将接受严格的宗教教育和修行，以准备将来继承前世的宗教地位。这包括学习佛教经典、参与宗教仪式和修行等。最终，由相应的佛教协会根据宗教仪轨和历史定制认定转世灵童。
整个转世过程不仅体现了藏传佛教的宗教仪式和信仰，也涉及到中央政府对宗教事务的管理和批准。