处理交通违章扣分，车主需要按照以下程序进行：
准备材料
携带个人驾驶证和车辆行驶证前往当地交警大队。
前往违章处理窗口
在交警大队的违章处理窗口，提交个人资料和车辆信息，进行业务办理。
查询违章记录
请求工作人员查询驾驶证分数和车辆的具体违章记录，包括违章次数、扣除的分数以及罚款金额。
确认并处理违章
确认违章信息无误后，接受处理，并打印交通违章缴款单，一式三份，签名确认并在下方注明“无异议”。
缴纳罚款
保留一份存根，另一份用于银行缴款。根据缴款单上的金额，在指定银行完成罚款的缴纳。
缴纳滞纳金
如果未能在规定期限内缴纳罚款，每日按罚款数额的3%加处罚款，加处罚款总额不得超出罚款数额。
处理异地违章
如果违章发生在外地，可能需要前往违章当地的交警队或车管所处理，或者通过邮寄资料委托他人办理。
确认违法信息消除
交完罚款后，票据保留。过几天再网上查询违法信息，确认违法信息已经消除。如果违法信息未消除，可携带交款单子到交警队的法制科说明情况，由工作人员确认后删除违法信息。
以上是处理交通违章扣分的一般程序，具体操作可能会因地区和具体情况有所不同。建议车主在处理违章时，提前咨询当地交警部门或交警大队，以确保流程顺利进行。