特殊审批程序是指针对特定情况或项目所采取的一种审批方式，这些程序通常不计入项目总审批时限，旨在提高政府的管理水平和服务质量，实现政府治理能力的提升。以下是一些特殊审批程序的例子：
特许程序
特许是行政机关代表国家向被许可人授予某种权利的许可方式，主要适用于自然资源的开发利用、公共资源的配置以及直接关系公共利益的特定行业的市场准入等。这种程序需要赋予特定权利，例如《行政许可法》第12条第2项所列事项的行政许可。
认可程序
认可是行政机关确定申请人是否具备特殊信誉、特殊条件或者特殊技能的许可方式，主要适用于确定申请人是否具备为从事提供公众服务并且直接关系公共利益的职业、行业所必需的特殊信誉、特殊条件或者特殊技能等资格、资质的事项，即行政许可法第12条第3项所列事项的行政许可。
核准程序
核准是行政机关对某些事项是否达到特定技术标准、技术规范作出判断的许可方式，主要适用于直接关系公共安全、人身健康、生命财产安全的重要设备、设施、产品、物品，需要按照技术标准、技术规范，通过检验、检测、检疫等方式进行审定的事项，即《行政许可法》第12条第4项所列事项的行政许可。例如，消防法规定的消防验收、国境卫生检疫法规定的动植物进出境检疫等。
药品特别审批程序
在突发公共卫生事件威胁时或事件发生后，为使应急所需防治药品尽快获得批准，国家食品药品监督管理局按照统一指挥、早期介入、快速高效、科学审批的原则，对所需药品进行特别审批。这种程序适用于突发公共卫生事件应急处理所需药品的药物临床试验、生产和进口等事项。
这些特殊审批程序通过简化流程、缩短时间、强化监督等方式，确保在特殊情况下能够快速、有效地处理相关事务，从而保障公共利益和社会秩序。