工程付账程序通常包括以下几个步骤：
承包商提出付款申请
承包商根据完成的工程量和合同条款，填报工程师指定格式的月报表，提出应得款项的申请。
工程师审核
工程师对承包商的付款申请进行全面审核，修正或删除不合理的部分，并计算付款净金额。
在计算付款净金额时，应扣除保留金、动员预付款、材料设备预付款、违约罚金等。
若净金额小于合同规定的临时支付的最小限额，则工程师不需开具任何付款证书。
业主支付
业主收到工程师签发的付款证书后，按合同规定的时间支付给承包商。
此外，具体的工程款支付流程可能因实际情况有所不同，但大致可以归纳为以下几个步骤：
施工单位提交申请
施工单位每月固定日期前提交《工程款支付申请表》，并提供完整的工程清单资料送监理审核，同时报送工程费付款审核表。
监理审核
监理在接到申请资料后一定时间内完成审核工作，对已完成形象进度进行审核，并提交《工程款支付证书》。
工程部审核
工程部收到资料后，工程部经理应在规定时间内完成审核工作，并在《工程款支付审批单》上提出审核意见签字，附加相关照片，然后提交总工程师审核。
总工程师审核
总工程师收到资料后，在规定时间内完成审核工作，并提交工程咨询单位审核，审核工作通常需要一定时间。
工程咨询单位审核
工程咨询单位完成审核后，提交《工程款支付审核书》及审核资料至总工程师。
最终支付
工程款经过层层审核确认无误后，最终由建设单位按合同规定支付给施工单位。
建议在实际应用中，各方应严格按照合同条款和内部流程进行操作，确保支付过程的准确性和及时性。