建筑业差额征税的账务处理主要涉及以下几个方面：
付款时的会计处理
当支付分包工程款时，应借记“工程施工—合同成本—分包工程”科目，同时贷记“应交税费—应交增值税”科目，表示已支付的分包工程款中包含了应交的增值税。
预交增值税的处理
预交增值税时，应借记“应交税费—应交增值税”科目，贷记“银行存款”科目，表示已预先缴纳的增值税。
开票时的会计处理
开具发票时，应按取得的全部价款及价外费用全额开具增值税普通发票，适用税率为3%。
如果是一般纳税人，并且采用简易计税方法，在计算应纳税额时，可以扣除支付的分包款后的余额，再按照3%的征收率计算应纳税额。
取得合规增值税扣税凭证时的会计处理
当取得合规的增值税扣税凭证时，应按允许抵扣的税额，借记“应交税费——应交增值税（销项税额抵减）”或“应交税费——简易计税”科目（小规模纳税人借记“应交税费——应交增值税”科目），贷记“主营业务成本”、“存货”、“工程施工”等科目。
简易计税方法下的会计处理
采用简易计税方法的建筑企业，在发生分包业务时，可以将扣除分包款后的余额作为销售额，并按照3%的征收率计算应纳税额。在纳税义务发生后，按允许抵扣的税额进行抵扣。
一般计税方法下的会计处理
一般纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，选择适用简易计税方法计税的，以取得的全部价款和价外费用扣除支付的分包款后的余额，按照3%的征收率计算应预缴税款。
总结：
建筑业差额征税的账务处理主要涉及对分包工程款的支付、预交增值税、开具发票、取得合规增值税扣税凭证以及不同计税方法下的税额抵扣等方面的会计处理。通过以上步骤，企业可以正确核算其应纳税额，并确保符合相关税法规定。