本二（二本）和本三（三本）的主要区别体现在以下几个方面：
录取批次
本二属于本科第二批次录取，而本三属于本科第三批次录取。通常情况下，二本在三本之前进行录取。
学费
本三的学费通常比本二高，而本二的学费又比一本稍高一些。三本院校的学费往往是本二的二倍以上。
办学性质
本二大多为省属等非重点院校，而本三主要为社会企业投资合办的独立学院，属于国家本科统招范畴，但独立学院的办学水平和师资力量相对较弱。
社会认可度
一本院校由于是重点高校，社会认可度和含金量较高，毕业生通常更容易获得好的就业机会和大企业的实习岗位。二本院校的社会认可度次之，三本院校的社会认可度相对较低。
教学资源和设施
一本院校通常拥有更好的教学资源和设施，如科研条件、师资力量和学生的学习氛围。二本院校在这些方面相对较好，而三本院校则相对较弱。
毕业证书
虽然二本和三本的毕业证书都表明是本科，但本三的毕业证书上会带有“独立学院”的字样，以示与二本和一本的区别。
综上所述，本二和本三在录取批次、学费、办学性质、社会认可度、教学资源和设施以及毕业证书等方面存在明显的差异。考生在选择院校时，可以根据自身情况和职业规划，综合考虑这些因素，选择最适合自己的院校。