组织建设方面存在问题的原因可以从多个角度进行分析：
组织结构不合理
组织结构不合理是导致组织建设层面问题的主要原因之一。不合理结构会导致组织内部分工不明确、权责不清晰、流程不顺畅等问题，进而影响组织的整体效率和绩效。
部门间沟通不畅
部门间沟通不畅是影响组织建设的重要因素。沟通不畅会导致信息传递受阻、资源无法共享、协作效率低下等问题，进而影响组织的整体协同效应。
决策效率低下
决策是组织运行的核心环节，决策效率低下会导致组织反应迟缓、错失机遇、资源浪费等问题，进而影响组织的竞争力和可持续发展。
缺乏明确的组织目标和战略规划
一些组织缺乏明确的目标和战略规划，导致内部部门工作方向不一致，资源浪费和效率降低。
岗位职责不明确
岗位职责不明确会导致员工不清楚自己的具体工作职责，影响工作效率和协作效果。
员工绩效评估不合理
绩效评估不合理，仅仅以工作完成情况作为评估标准，忽视员工的实际贡献和潜力，会影响员工的工作积极性和组织的整体绩效。
党支部班子配备不合理
党支部班子配备不够合理，存在年龄结构老化、知识水平有限、专业技能缺乏等问题，导致整体创新能力和适应新形势的能力不足。
党支部活动场所建设滞后
党支部活动场所建设滞后，无法满足党员活动需求，影响党组织活动的正常开展和党员之间的交流互动。
基层党组织设置不够优化
基层党组织设置存在“大支部”和“小支部”并存的现象，影响党组织活动开展和党员管理的效率和质量。
党组织生活制度执行不严格
党组织生活制度执行不严格，如“三会一课”、主题党日等活动不严格，影响党组织的凝聚力和战斗力。
缺乏重视和认识不足
一些地方和单位对党建工作的重视不够，认为党建工作只是一项形式上的工作，缺乏认识到党建工作对于党的事业发展的重要性。
组织管理不规范
一些党组织的组织管理存在不规范的现象，如党委会议制度不健全、会议记录不规范、会议纪律不严格等。
干部队伍建设不够健全
干部队伍中存在个别党员干部缺乏理想信念、受到量化考核的侵蚀、庸俗化问题、内外交往不规范等问题。
思想认识不到位
一些党员干部和党务工作者对党务工作及党建工作的重要性和作用缺乏足够的思想认识，导致党务工作执行不力。
存在形式主义、官僚主义现象
倾听基层意见不够、深入一线调研不全面、关心职工不够等问题，导致党务工作与安全生产不协调。
政治生态环境的变化
随着社会经济的发展和党的事业的深入推进，党的面临的问题也在不断变化，一些地方和单位在党建工作中没有及时调整和适应，导致党建工作的滞后性和不适应性。
综上所述，组织建设方面存在问题的原因多种多样，涉及组织结构、沟通协作、决策效率、目标规划、岗位职责、绩效评估、班子配备、场所建设、制度执行、重视程度、组织管理、干部队伍建设和思想意识等多个方面。要解决这些问题，需要从多个层面入手，进行系统的分析和改进。