农民合作社的管理制度包括多个方面，旨在规范合作社的运营，保护成员权益，并提高合作社的经济效益。以下是一些关键的管理制度：
办社宗旨及原则
农民专业合作社以服务社员为宗旨，谋求全体成员的共同利益。
坚持以农民为主体，入社自愿，退社自由，成员地位平等。
实行民主管理和盈余主要按照社员与合作社的交易额比例返还的原则。
财会人员职责
合作社设会计和出纳，负责财务管理工作，核算经济业务，编制会计报表。
执行财经纪律和财务管理制度，保持清正廉洁，坚持原则。
货币资金管理制度
实行账款分管制度，现金管理由会计员和保管员分别负责。
实行备用金制度，确保日常零星开支，超过限额的现金存入银行。
不得借支、挪用合作社现金，不准坐收坐支现金，不准白条顶库。
银行存款实行备查制度，每月与银行核对，确保账账相符。
收入管理制度
合作社收入包括社员会费、股金、利润收入、接受的捐赠款物、政府扶持资金等。
收入管理要规范，确保合法合规。
登记注册与办公室布局
按照农民专业合作社登记管理条例进行登记注册，取得营业执照、组织机构代码、税务登记等证件。
办公室布局要规范，体现亲民性，悬挂合作社全称、牌子等，墙上要挂上合作社章程、管理制度等。
社员管理
凡入社农户需填写入社申请表，发放社员证，建立成员账户，记录交易信息。
社员退社需提前申请，经理事会批准后办理退社手续，退还股金及公积金。
财务制度与会计制度
建立健全会计机构，聘任会计人员，参加财务培训。
严格会计核算管理，设立成员账户，量化成员出资、公积金等。
使用便捷财务软件规范会计核算，形成完整会计档案，项目形成的固定资产及时入账。
费用支出与审批
合作社费用支出由理事长负责审批，一般经费开支在一定金额以内由理事长直接审批，超过一定金额需经理事会集体审核后审批。
办理各项支出需取得合法原始凭证，凭证需有经办人、审批人签字方可入账。
年度收益分配
年度收益分配顺序依次为弥补上年度亏损、计提积累、向社员进行盈余返还、向投资者分利。
生产管理制度
统一制定生产方案，统一供应农资，统一技术标准，统一产品认证，统一指导服务。
产品销售管理制度
积极开拓市场，扩大销售网络，使用统一商标品牌，统一包装销售成员产品。
优先收购成员产品，严格按质量标准确定价格，对待成员公平公正。
这些管理制度共同构成了农民合作社的运营框架，确保了合作社的规范运作和可持续发展。建议各合作社根据自身实际情况，制定和实施相应的管理制度，以提升合作社的整体运营效率和经济效益。