国有农用地管理办法主要包括以下几个方面：
国有农用地的定义和范围
国有农用地是指直接用于农业生产的国有土地，包括耕地、林地、草地、农田水利用地、养殖水面等。
管理原则
科学规划，合理利用。
保护生态，有序开发。
节约集约，有偿使用。
保障权益，依法登记。
依法管理，强化监督。
部门职责
自然资源部门负责国有农用地的调查、测绘、权属确认及矛盾纠纷化解，建立管理台账和监测管理信息系统。
使用和管理
国有农用地使用应严格根据土地利用总体规划确定的用途进行，已开发利用且已确权登记的国有农用地按照本办法管理，未确权登记的应依照本办法进行确权登记和管理。
使用国有农用地应遵循科学规划、合理利用、保护生态、有序开发的原则，保障使用权人的合法权益。
规划建设与资金保障
明确规划编制、国有农用地建设内容及管理和建设资金保障。
监督管理
规定巡查监管制度、农地转用及征收、临时使用、环境保护等方面的监督管理要求。
法律责任
明确破坏农地、违法建设、骗取土地使用权、污染农业用地、行政人员违法的法律责任。
使用权配置
国有农用地使用权配置应遵循所有权与使用权相分离的原则，设立、调整、续期、收回国有农用地使用权。
租赁和承包
国有农用地使用权的租赁期限一般不超过五年，确需超过五年的，须经市人民政府批准。以租赁方式取得的国有农用地使用权，使用权人可以转租。
登记和备案
国有农用地使用权人应当依法取得使用权，并进行登记。以承包经营以外的合法方式使用国有农用地的，应参照相关实施细则办理使用权登记。
这些管理办法旨在加强国有农用地管理，规范使用行为，促进农业发展和生态环境保护，推动经济社会可持续发展。各地可根据实际情况制定具体实施办法，并报上级政府备案。