租用农村耕地的程序包括以下几个步骤：
申请
用地单位向市、县国土资源管理部门提出土地租赁申请，并准备相关申报材料。
受理
业务受理窗口受理申请，审查资料是否齐全、是否符合法定形式和达到审批受理要求。
供地方案报批
市、县国土资源部门根据土地利用总体规划、年度土地利用计划、城市规划、市场状况，编制国有土地使用权呈报说明书和租赁供地方案，经过局内会审后，报市、县人民政府批准。
签订合同
市、县人民政府批准后，由市、县国土资源部门与土地使用者签订《国有土地使用权租赁合同》。合同内容包括当事人名称、土地的位置和面积、土地用途和其他使用条件、租赁期限、租金标准及其调整办法、租金的支付日期和支付方式、土地交付的条件和时间、合同的解除和终止条件等。
缴费
用地单位缴纳土地租金和契税，领取租赁合同。
归档和建库
将业务相关资料进行归档，并建立数据库。
此外，还需要注意以下事项：
农村集体土地出租必须经过村民集体民主表决，遵循“四议两公开”工作流程，租赁期限不得超过二十年。
承租方需按规定向房地产登记机构办理租赁土地使用权登记手续，并在登记完成后取得房地产权证书。
建议在租用农村耕地时，详细阅读并遵守相关法律法规，确保租赁程序的合法性和有效性。