程序违法的严重性及其处理方式主要取决于违法的性质、严重程度及其对案件公正处理的影响。以下是处理程序违法的几种常见方式：
内部纪律处分
对于轻微的程序违法，可以给予警告、记过等纪律处分。
对于严重损害当事人权益的程序违法，相关责任人员可能面临更严厉的处分，如撤职、开除等。
行政诉讼
当事人若认为行政行为程序违法，可提起行政诉讼，要求法院确认该行为无效或撤销。
行政诉讼中，法院若发现程序违法，可判决确认违法、撤销或部分撤销行政行为，并要求重新作出处理决定。
刑事追究
若程序违法构成犯罪，相关责任人员将依法追究刑事责任。
程序违法若严重侵犯公民诉讼权利或其他合法权益，并造成损害，受害人可申请国家赔偿。
其他处理方式
对于违反法定程序的行为，上级行政机关或有关部门可责令改正，并对直接责任人员依法给予行政处分。
在某些情况下，如涉及行政处罚，违法机关需重新作出处理决定，且不得使用相同的事实和理由。
建议
及时纠正：发现程序违法后，相关机关应及时采取纠正措施，避免违法后果扩大。
透明处理：处理程序违法时，应保持透明，保障当事人的知情权和参与权。
严格追责：对于严重程序违法，应严格追究相关责任人员的法律责任，以维护法治秩序和司法公正。
通过以上方式，可以有效处理程序违法问题，确保法律的正确实施和司法的公正性。