手动编写程序文档通常包括以下几个步骤：
确定程序的功能和需求
明确编写程序的目的和功能，例如创建一个图像处理程序或一个学生管理系统。
设计程序结构
根据功能需求，设计程序的整体结构，包括功能模块、类和函数等。
编写伪代码或算法
使用伪代码或算法描述程序的逻辑流程，确定各个模块之间的关系。
编写代码
按照伪代码或算法，使用具体的编程语言编写代码，并根据需求逐步实现各个模块。
调试和测试
编写完代码后，运行程序进行调试和测试，确保程序运行正常且符合功能要求。
优化和完善
根据测试结果和用户反馈，对代码进行优化和完善，提高程序的性能和可靠性。
文档编写
编写程序文档，包括程序说明、模块说明、接口文档等，方便其他人理解和使用程序。
版本控制和发布
使用版本控制工具对程序进行管理，随着需求变更和修复bug，发布新的程序版本。
具体工具和方法
文本编辑器：可以使用任何文本编辑器（如记事本、TextEdit或Sublime Text）来编写代码和文档。
编程语言特定的工具：例如，使用Visual Studio编写C代码，使用Eclipse编写Java代码。
版本控制工具：如Git，用于管理代码的版本和变更历史。
文档生成工具：如MkDocs，可以使用Markdown语法编写文档，并生成美观大方静态网站。
示例
使用MkDocs编写文档
安装MkDocs
```bash
pip install mkdocs
```
创建一个新的文档项目
```bash
mkdocs new my-project
cd my-project
```
配置MkDocs
编辑`mkdocs.yml`文件，配置网站的基本信息和导航结构。
编写文档内容
在`docs`目录下创建Markdown文件，例如`index.md`、`guide.md`和`api.md`，并编写相应的内容。
生成文档
```bash
mkdocs serve
```
通过以上步骤，你可以手动编写程序文档，并使用工具生成结构化的文档网站，方便他人查阅和使用。