在Java中，关闭运行的程序可以通过以下几种方法实现：
使用System.exit（）方法
`System.exit（0）；` 可以立即终止Java程序，其中参数0表示正常退出，非零值表示异常终止。
使用Runtime类的exec和destroy方法
可以通过`Runtime.getRuntime（）.exec（cmd.exe /C start wmic process where name='cmd.exe' call terminate）；`来关闭正在运行的cmd窗口。
另外，可以通过创建一个`Process`对象并调用其`destroy（）`方法来关闭进程，例如：
```java
Process process = Runtime.getRuntime（）.exec（cmd）；
process.destroy（）；
```
使用关闭钩子（Shutdown Hook）
在JVM关闭之前，可以注册一个关闭钩子，在钩子中执行扫尾工作，确保程序安全退出。例如：
```java
Runtime.getRuntime（）.addShutdownHook（new Thread（） {
@Override
public void run（） {
// 在JVM关闭之前执行收尾工作
System.out.println（"do shutdown hook"）；
}
}）；
```
使用操作系统相关命令
可以通过执行操作系统命令来关闭Java程序。例如，在Windows上可以使用`taskkill`命令，在Linux上可以使用`kill`命令。
建议
正常退出：推荐使用`System.exit（0）`方法，因为它简单且直接。
异常退出：在程序非正常退出时，可以使用`System.exit（1）`或其他非零值表示异常情况。
多线程程序：在多线程程序中，必须关闭所有非守护线程，可以使用`Thread.interrupt（）`方法来中断线程。
安全性：在注册关闭钩子时，要注意执行的动作不能耗时太久，也不能再执行注册或移除关闭钩子的操作，更不能调用`System.exit（）`。
通过以上方法，可以有效地关闭Java程序，并根据不同的场景选择合适的方法。