通关作业程序通常包括以下几个主要步骤：
申报
填写进出口货物报关单；
提供法定单证，如进出口货物许可证、检验检疫证明、随附货运和商业单证（如装箱单、商业发票、提货单）；
减免税、免验证明等。
审单
对报关单进行编号登记、签注申报日期并装订；
审核报关单内容，包括初审和复核。
查验
派员会同海关查验货物；
负责搬移、开箱及验毕恢复原状；
查验单货是否一致，到监管区外查验，向报关单位收取规费；
如发生货物损坏，应向报关单位赔偿，税部门的问题或所需文件；
凭海关开具的缴款通知书到指定银行缴纳关税和国内税。
征税
审价；
依据相关税率计征关税和依法减免；
开出银行缴款书。
放行
凭报关员证及领单凭据领取放行单及其他发还单证；
到海关监管仓库提货或装货、启运。
后续管理
审核关税及规费是否缴讫；
审核应附单证是否核销；
审核各项通关程序是否完成，有无缺漏。
建议
标准化流程：确保所有步骤符合海关规定，减少人为错误。
信息化管理：利用电子申报和EDI系统提高申报和审单效率。
风险管理：实施风险分析和布控，对高风险报关单进行重点审核。
培训与人员配置：定期对报关员进行培训，确保其熟悉最新政策和流程，按专业分工配置人员以提高工作效率。
这些步骤构成了一个完整的通关作业程序，旨在确保进出口货物的合规性和高效性。