上传多个网站程序可以通过以下几种方法实现：
TCP端口实现法
在同一台服务器上，通过不同的TCP端口来区分不同的网站。例如，在IIS管理器中为每个网站分配一个唯一的端口号（如80, 8080, 443等）。
IP地址实现法
为每个网站分配一个独立的IP地址，通过IP地址来访问不同的网站。这种方法需要在服务器上配置多个IP地址，并在IIS管理器中为每个IP地址创建一个网站。
主机头实现法
通过HTTP主机头字段来区分不同的网站。在IIS管理器中，可以为每个网站配置不同的主机头名称，从而实现在同一IP地址和端口上运行多个网站。
FTP上传法
使用FTP工具（如CuteFTP、FileZilla等）将网站文件上传到服务器的指定目录。需要先获取服务器的FTP登录信息（包括用户名、密码和主机地址），然后通过FTP工具连接到服务器并进行文件传输。
阿里云服务器上传法
在阿里云服务器上，可以通过SSH协议运行Python脚本或Ruby脚本来上传网站。如果使用Web框架（如Django、Ruby on Rails等），可以利用这些框架提供的部署工具进行上传。
建议
选择合适的方法：根据服务器的操作系统、IIS版本以及个人喜好选择最合适的方法。
测试：在上传网站后，务必进行测试以确保所有网站都能正常访问。
安全性：确保使用强密码，并定期更新服务器和FTP账户的密码，以保障服务器的安全性。
希望这些方法能帮助你顺利上传多个网站程序。