建筑工程施工许可证的办理流程主要包括以下几个步骤：
申请前的准备工作及办理条件
施工场地已基本具备施工条件。
已经办理该建筑工程用地批准手续。
在城市规划区的建筑工程，已经取得规划许可证。
需要拆迁的，其拆迁进度符合施工要求。
已经确定建筑施工企业。
按照规定应该委托监理的工程已委托监理单位。
有满足相关设计规范要求的施工图纸。
已在质量监督主管部门及安全监督主管部门办理相应的质量、安全监督注册手续。
申请
建设单位向发证机关领取《建筑工程施工许可证申请表》。
建设单位持加盖单位及法定代表人印鉴的《建筑工程施工许可证申请表》，并附相关证明文件，向发证机关提出申请。
提交材料包括：
按规定填写、盖章的《建筑工程施工许可证申请表》一式三份。
建设工程规划许可证正本、附件的复印件。
用地批准手续（国有土地使用证或有关批准文件）复印件。
施工图设计文件审查通知书原件。
招投标管理部门出具的施工合同备案表。
招投标管理部门出具的监理合同备案表（依法应当委托监理的工程提交）。
建筑施工企业安全生产管理人员安全生产考核合格证书（B本、C本）和《地上、地下管线及建（构）筑物资料移交单（表AQ-A-2）》原件（施工安全监督备案用）。
项目建设资金落实证明原件。
人防部门出具的人防施工图备案回执。
法人委托书。
分类填报的《北京市建筑节能设计审查备案登记表》（一式三份，建筑节能设计审查用）。
到建筑工程管理科办理
建设单位将申请表和相关材料提交至建筑工程管理科。
受理与决定
建筑工程管理科受理后，在十五个工作日内作出是否许可的决定。
资料符合要求的，颁发建筑工程施工许可证。
对于证明文件不齐全或者失效的，应当限期要求建设单位补正，审批时间可以自证明文件补正齐全后作相应顺延。
对于不符合条件的，应当自收到申请之日起7日内书面通知建设单位，并说明理由。
施工过程中变更
建筑工程在施工过程中，建设单位或者施工单位发生变更的，应当重新申请领取施工许可证。
以上流程和所需材料可能因地区和具体情况有所不同，建议在办理前详细咨询当地建设行政主管部门以获取准确信息。