防止Java软件被复制的措施包括：
使用Java Obfuscator
对Java程序进行打乱，使其难以反编译和查看源代码。但这种方法对于掌握工具的人几乎是透明的，且易受重新整理软件的影响。
硬件加密锁
利用硬件加密锁，如HASP，对软件进行加密处理，并确保加密过程在特定的硬件设备上进行。这种方式可以有效防止反编译，因为加密后的程序与硬件紧密相连，难以被剔除。
隔离Java程序
通过限制用户对Java Class程序的访问，防止未经授权的拷贝。这可以通过注册复杂的加密算法来实现，增加破解难度。
文件加密
对Java程序文件（如CLASS或JAR包）进行加密，生成新的Java程序。由于加密过程在锁内完成，采用128位AES算法，反编译工具无法反编译出加密后的程序。
USB端口管理软件
通过专业的USB端口管理软件禁止U盘复制电脑文件，从而间接保护Java程序不被非法复制和传播。
基于JVMTI的代码加密保护工具
使用C++编写工具，通过JVM Instrumentation（JVMTI）机制对Class文件进行加密，需要在执行时引入解密库文件。这种方式提供了更深层次的保护，因为代码在运行时才能解密。
其他措施
包括使用复杂的注册算法、防止文件拷贝、禁用右键菜单和“另存为”功能等，但这些方法的效果有限，且易受技术高超的破解者攻击。
建议
综合使用多种保护措施：单一的保护方法可能不够安全，建议结合使用多种方法，如硬件加密锁和代码混淆，以提高软件的安全性。
定期更新和修补：随着技术的发展，新的破解手段不断出现，因此需要定期更新软件和保护措施，以应对新的威胁。
法律手段：除了技术手段外，还可以通过法律手段保护知识产权，如申请软件著作权，追究侵权行为。
通过上述措施，可以在一定程度上防止Java软件被复制和盗版，保护开发者的合法权益。