软件系统支出的核算方法如下：
购买系统软件的会计处理
将软件费用计入“管理费用”科目，借记“管理费用——软件费”账户，贷记“银行存款”或“其他应付款”等账户。
如果软件具有固定资产性质，则可以采用分期摊销方式，将软件费用在软件使用寿命内分摊计入“管理费用”科目。
如果购买的是服务型软件，则按照合同规定支付的费用计入“管理费用——软件服务费”科目。
软件开发支出的会计处理
软件开发支出包括人力成本、设备成本、材料成本及其他成本。人力成本包括开发人员的工资、福利和培训费用，设备成本包括购买和维护开发所需的硬件和软件，材料成本包括购买和使用开发所需的物料，其他成本包括租金、公用事业费用和保险费用等。
软件开发支出需要考虑软件开发的生命周期，包括设计、编程、测试和维护等阶段，每个阶段都会产生一定的成本。
软件购买的资本性支出处理
将系统软件的购买记录作为一笔资本性支出，而每年支付的维护费则作为一笔支出，纳入到日常经营成本中。
资本性支出是指为了增加资产使用寿命、提高资产性能或满足法律规定等而发生的投资性支出，不是一次性的，而是分期投资，支出的金额分散到未来的某几个期间，按照折旧金额的大小结转到收入类科目或费用类科目中。
软件升级和维护费用的会计处理
购买软件后续产生的升级费用、维护费用等，也应当被纳入无形资产的范畴进行会计处理。具体会计分录包括：
软件金额较大时，计入无形资产，分录为：借：无形资产——财务软件，贷：银行存款/库存现金。
软件金额较少时，计入当期损益，分录为：借：管理费用，贷：银行存款/库存现金。
高新技术企业的研发费用核算
软件开发企业进行费用核算时，一般将中间费用计入“管理费用--研发费用”，特别是对于高新技术企业，研发费用支出比例是资质认证的重要指标，人力成本可以进入研发费用。
高新技术项目可以到税务局备案，享受税前扣除，并加计50%扣除所得税的优惠政策。
综上所述，软件系统支出的核算方法根据软件的性质、用途及企业的会计政策有所不同。购买系统软件的费用通常计入管理费用或无形资产，而软件开发支出则需要详细记录各项成本，并在财务报表中进行适当的摊销或费用化处理。对于高新技术企业，研发费用有特定的核算和税收优惠政策。