企业增资需要缴纳的印花税，其税率是按照 万分之五来计算的。如果公司已经缴纳过印花税，那么只需要对资本增资部分进行计算并缴纳相应的印花税。这一规定主要依据《中华人民共和国印花税法》以及相关的税务规定。
具体来说，企业在进行增资时，需要根据实际增资金额来计算应缴纳的印花税金额。计算公式为： 增资印花税 = 增资金额 × 印花税税率。在这个例子中，如果增资金额为100万元，那么应缴纳的印花税金额就是100万元 × 0.0005 = 500元。
此外，如果公司注册资本已经缴纳过印花税，那么在后续增资时，只需要对增加的部分进行计算并缴纳印花税。这一规定有助于避免对同一笔资金重复征税，同时也简化了企业的税务申报和缴纳流程。
需要注意的是，税法规定可能会有所变动，因此企业在实际操作中，建议咨询专业的税务顾问或者税务机关，以确保按照最新的税务规定进行申报和缴纳。