党组织对违反纪律的党员应当坚持以下原则：
惩前毖后、治病救人：
党组织在处理违纪党员时，要以教育为主，帮助其认识错误、改正错误，从而达到既严肃纪律又保护党员的目的。
执纪必严、违纪必究：
对违纪行为必须严格依照党的纪律进行查处，做到有纪必执、有违必查，确保纪律的严肃性和权威性。
抓早抓小、防微杜渐：
党组织要注重发现和处理违纪行为的苗头性问题，及时纠正，防止小错酿成大错，体现纪严于法、纪在法前的要求。
实事求是：
对违纪行为的认定和处理，要以事实为依据，以党章和其他党内法规及国家法律法规为准绳，确保处理结果的公正和准确。
党纪面前一律平等：
党组织和党员都必须严格遵守党的纪律，不允许有任何党组织和党员凌驾于纪律之上，维护党的纪律的普遍性和公正性。
民主集中制：
在处理违纪问题时，要经过党组织集体讨论决定，不允许任何个人或少数人擅自决定和批准，确保决策的科学性和民主性。
宽严相济：
在惩戒违纪党员时，既要严肃纪律，又要兼顾教育挽救，做到宽严适度，体现党的纪律的严肃性和人文关怀。
这些原则共同构成了党组织对违反纪律党员进行处理的基本框架，旨在通过严格管理和教育，维护党的纪律的严肃性和权威性，同时保护党员的合法权益，促进党员队伍的健康发展和壮大。