修改Java程序主要有以下几种方法：
直接修改源码文件
使用文本编辑器打开源码文件，找到需要修改的部分，进行编辑，然后保存并重新编译。这是最直接的方法，适用于对程序逻辑进行小范围修改的情况。
使用反射
通过Java反射机制，可以在运行时动态地修改类的属性、方法等。这种方法适用于需要在运行时动态改变程序行为的场景。
字节码操作工具
使用ASM、Javassist等工具可以直接操作字节码，实现对类的修改。这种方法适用于需要更深层次修改程序行为的场景，比如添加或修改方法、字段等。
工具库
使用Byte Buddy、CGLib等库可以简化代码修改的过程，提供了一些API来修改类的行为。这些库通常更容易使用，尤其适合快速原型开发或框架开发。
编译时注解处理器
通过编写自定义的注解和注解处理器，可以在编译时修改源码。这种方法适用于需要在编译阶段就确定修改的逻辑的场景。
类加载器
通过自定义类加载器，可以在加载类的过程中对字节码进行修改。这种方法适用于需要修改类加载逻辑的场景。
动态代理
通过实现代理模式，可以在代理对象的方法执行前后进行修改。这种方法适用于需要在方法调用前后插入额外逻辑的场景。
字节码增强工具
使用AspectJ等工具可以在编译时或者运行时对字节码进行增强，实现对源码的修改。这种方法适用于需要在多个地方添加横切关注点的场景。
具体操作步骤示例
方法一：修改JAR文件
解压JAR文件
使用WinRAR等工具解压JAR文件，找到`META-INF`文件夹。
修改MANIFEST.MF文件
使用记事本打开`META-INF/MANIFEST.MF`文件，在文件末尾添加以下两行（可选）：
```
Nokia-MIDlet-auto-start: no
Nokia-MIDlet-no-exit: true
```
重新打包JAR文件
将修改后的`META-INF`文件夹拖回JAR文件中，重新压缩成新的JAR文件。
方法二：修改JAD文件
打开JAD文件
使用记事本打开JAD文件。
添加指定行
在JAD文件的最后添加以下两行（可选）：
```
Nokia-MIDlet-auto-start: no
Nokia-MIDlet-no-exit: true
```
重新打包JAR文件
将修改后的JAD文件和JAR文件一起拷贝到手机进行安装。
建议
备份原始文件：在进行任何修改之前，务必备份原始文件，以防修改失败导致程序无法运行。
测试修改：在修改完成后，务必在开发环境中进行充分测试，确保修改没有引入新的问题。
使用版本控制：对于大型项目，建议使用版本控制系统（如Git）来管理代码，便于追踪修改历史和回滚到之前的版本。