程序主要存放在 存储器中。存储器是计算机中用于存储数据和指令的硬件设备，它允许CPU按顺序读取和执行指令。程序在运行时会被加载到内存中，这样CPU才能逐条执行这些指令。内存分为不同的类型，包括主存储器（RAM）和辅助存储器（如硬盘、U盘等）。主存储器（RAM）是计算机运行时程序和数据的主要存储地，具有易失性，意味着在断电后数据会丢失。辅助存储器则用于长期存储程序和数据，即使断电也不会丢失。
具体到某些特定应用或系统，程序可能存储在不同的位置：
C盘的Program Files文件夹：
这是许多程序默认的安装位置，例如QQ等应用程序。
主板的内存条：
某些控制系统或专用设备，如发那科机器人，会将用户程序存储在主板的内存条中，具体是内存条中的TPP区域。
RAM：
计算机正在运行的程序一般都会存放在RAM中，这是与CPU直接进行数据交换的存储器，具有高速读写能力。
根据以上信息，可以得出结论：程序主要存放在存储器中，具体位置可能因程序类型、操作系统和应用场景的不同而有所变化。