分居离婚需要按照法律规定的程序办理，主要有两种方式：协议离婚和诉讼离婚。
协议离婚
双方自愿：
夫妻双方自愿离婚，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
冷静期：
登记之后需等待30天冷静期即可完成。
所需材料：
携带本人的户口簿、身份证、结婚证及离婚协议书到常住户口所在地的婚姻登记机关办理离婚登记。
诉讼离婚
提起民事诉讼：
原告向有管辖权的法院申请立案，提交本人身份证、结婚证、户口簿、起诉状及相应证据等材料，并缴纳诉讼费。
法院审理：
法院立案后会进行调解，如果调解不成会开庭审理，并作出判决。判决宣告时公开进行，但是否当庭宣判则视法庭审理情况及结果而定。
分居证据：
需要提供分居期间的居住证明、费用凭证、证人证言、通讯记录等证据，以证明分居满两年且因感情不和。
管辖权：
一般原则是向被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。
其他注意事项
分居原因和时间：
分居原因必须是因感情不和，而非其他客观因素，且分居时间需满两年。
调解无效：
若感情确已破裂且调解无效，法院应当准予离婚。
线上诉讼：
双方在外地不方便回户籍地办理离婚的，可以选择网上立案和线上开庭，无需见面，流程较快。
综上所述，分居离婚可以选择协议离婚或诉讼离婚两种方式，具体程序包括签订离婚协议、等待冷静期、办理离婚登记或提起民事诉讼、进行调解和开庭审理等步骤。建议在选择离婚方式时，充分考虑双方实际情况和需求，选择最适合自己的途径。