运管扣车的程序如下：
现场录像和扣车单
执法人员会对涉嫌违法的车辆进行录像取证，并开具扣车单。扣车单上会明确扣车原因、处理时间、地点以及车主需要携带的相关文件。
缴纳罚款
车主需要按照扣车单上的要求，到指定地点缴纳罚款。罚款金额依据《中华人民共和国道路运输条例》第六十四条的规定，不符合条例规定条件的人员驾驶道路运输经营车辆的，处200元以上2000元以下的罚款。
开具提车单
缴纳罚款后，车主会收到运管部门开具的提车单。提车单是车主提取被扣车辆的重要凭证。
提车
车主携带提车单和缴纳罚款的相关凭证，到指定的停车场提取被扣车辆。
申诉
如果车主对扣车决定有异议，可以在接到扣车单后的24小时内进行申诉。申诉电话和地址会在扣车单上提供，逾期未申诉将默认录入执法系统。
暂扣驾驶证
根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十五条的规定，未经许可擅自从事道路旅客运输站（场）经营或未取得道路运输经营许可的车辆，可能会被暂扣驾驶证，期限通常在3个月至6个月之间。
总结：
运管扣车的程序包括现场录像、开具扣车单、缴纳罚款、开具提车单、提车和申诉等环节。车主需要按照这些步骤配合运管部门，以确保车辆能够尽快取回并合法上路。