种业执法程序主要包括以下几种：
简易程序
执法人员至少2个人到场，表明身份，说明处罚理由和依据。
制定处罚决定书并交付当事人。
一般程序
立案：对符合立案条件的案件，应在七日内立案。
调查取证：执法人员不得少于二人，全面、客观、公正地调查，收集证据，如书证、物证、视听资料等，并制作相应笔录。必要时可抽样取证、先行登记保存证据，对专门性问题交由鉴定部门鉴定。
处罚审查：承办人员调查终结后，整理分析证据材料，提出处理意见，填制《案件处理意见书》。重大行政处罚决定需报局法制机构法制审核后，提交局领导班子集体讨论决定，再报局长审批。
作出处罚决定：根据调查结果和审查意见，作出行政处罚决定，并送达当事人。
送达与执行：将处罚决定书当场交付当事人，并告知其依法申请行政复议或提起行政诉讼的途径和期限。当事人拒签的，应在处罚决定书上注明。依据《行政处罚法》相关规定，执行或督促当事人履行处罚决定，并在规定时间内将案件有关材料交至所属农业行政处罚机关，填制《行政处罚结案报告》并立卷、归档。
听证程序
听证程序是在特定情况下的程序，具体步骤包括立案、调查取证、核审、告知、听证、下达行政处罚决定等。
这些程序确保了种业执法的合法性、公正性和透明度，保障了当事人的合法权益。