蛋鸭的免疫程序主要包括以下几项：
1日龄
鸭肝灵，皮下注射。
7日龄
肝炎弱毒苗，1羽份，肌肉注射。
15日龄
浆腹炎和大肠杆菌二联苗，0.4毫升皮下注射。
20日龄
禽流感疫苗，半倍量皮下注射。
25日龄
禽流感 H5+H9，颈部皮下注射0.5毫升。
30日龄
鸭瘟弱毒苗，2羽份，皮下或肌肉注射。
120日龄
禽大肠杆菌病和禽霍乱，大肠杆菌灭活苗1毫升/只肌肉注射，同时注射禽霍乱油苗。
产蛋前
禽流感 H5N1Re-4-5，胸部皮下注射。
建议在实际操作中，根据鸭场母鸭的免疫状况、雏鸭的抗体水平和饲养地区疫病的流行特点等来适当调整免疫程序。此外，若鸭群健康状况差或正发病，可适当延迟疫苗接种时间。在产蛋期，特别是产蛋高峰期，尽量不要进行免疫接种。