小鹅瘟的防疫程序主要包括以下几个方面：
种鹅免疫
种鹅在开产前15-30天每只注射小鹅瘟鸭胚弱毒疫苗0.1毫升，所产种蛋可含母源抗体，使雏鹅获得保护。
种鹅产蛋前1个月，每羽注射小鹅瘟疫苗1毫升，2周后所产种蛋孵出的雏鹅免疫保护率可达95%以上。
雏鹅免疫
对于未有母源抗体的雏鹅，可在雏鹅出壳48小时内接种鹅胚化或鸭胚化的小鹅瘟雏鹅弱毒疫苗。
雏鹅1日龄接种小鹅瘟疫苗，7日龄接种禽流感疫苗，15日龄接种副粘病毒油乳灭活疫苗，20日龄再加强免疫禽流感等。
无母源抗体的雏鹅，应在雏鹅破壳后的3-5天内注射小鹅瘟免疫血清，预防量每羽0.5毫升。
雏鹅7日龄皮下注射小鹅瘟弱毒苗，每羽1羽份；15日龄二免注射1.5头份。
紧急治疗
对已发生小鹅瘟的雏鹅群，根据日龄大小注射小鹅瘟高温血清，具体剂量为5-10日龄皮下注射1~1.2ml，10-15日龄注射2~2.5ml，15-25日龄注射3~3.2ml，30日龄以上注射4ml。
对病雏鹅要隔离单独饲养，死亡雏鹅及淘汰雏鹅的尸体要深埋或焚烧。
早发现、早用药，一旦发现小鹅瘟要立即用药，可以给病鹅注射小鹅瘟精制蛋黄抗体，如果症状比较严重，还需要配合使用抗微生物药物以防止继发其他疾病。
消毒和隔离
孵化用的一切设备、用具，在每次使用前后都必须进行彻底消毒，消毒可采用福尔马林熏蒸法。
对发病的和暂无临床表现但与病雏接触过的假定健康雏，应及早逐只注射小鹅瘟高免血清或卵黄抗体，并且可以同时使用抗微生物药物以防止继发其他疾病。
彻底清除鹅舍内的粪便和污物，饲槽、饮水器用0.1%高锰酸钾浸泡、洗刷、日晒。
发病鹅群应采取严格的封锁和隔离措施，并对发病鹅群积极地采取治疗。
通过以上综合防疫措施，可以有效预防和控制小鹅瘟的发生和传播。