认祖归宗的程序通常包括以下几个步骤：
寻根问祖
搜集资料：包括先祖迁居前居住地的确切记载、始迁祖的名号、字、号、排行字号、生卒年月及相关生平事迹等。
对接信息：通过网络交流或询问族中老人，确认寻根信息，包括祖先名号、祖坟祖墓等。
实地考查：根据寻根信息，实地考查祖居地，确认祖先的详细位置。
协商与准备
协商事宜：认祖者与祖居地的族人事先协商好认祖归宗的相关事宜。
准备物品：认祖者准备好香烛、鞭炮、供品等物品。
仪式过程
宣布开始：礼生（司仪）宣布“认祖归宗”仪式开始，鸣鞭炮，请出族谱。
祭祖：认祖者按祖居地习俗拜天地、祭祖。
族长发言：族长（长辈）发言，包括欢迎语、介绍语、确认语和祝颂语。
续写族谱：将认祖者及其家人的名字、简介等续写在族谱上相应的位置。
安放神主牌位：将认祖者的始祖神主牌位放入总祠神龛。
发言答谢：认祖者（或代表）发言答谢，全体人员祭拜列祖列宗。
祭扫先祖墓：在长辈的带领下，认祖者祭扫先祖墓。
设宴庆祝：举办认祖归宗宴会，邀请族人参加。
告辞：认祖者告辞，祖居地族长赠与总祠中供奉祖先的香炉里的香灰与祠堂门前（或附近）泥土各一袋，交由认祖者回家供奉。
法律与行政程序
改姓恢复祖姓：若需要改姓恢复祖姓，可能需要向户籍所在地的派出所提交改姓申请书，并依照相关法律程序进行。
建议
详细记录：在整个认祖归宗过程中，详细记录所有相关的资料和信息，以便后续查证和确认。
尊重习俗：在认祖归宗的仪式中，尊重并遵循祖居地的习俗和传统礼仪。
法律咨询：在进行认祖归宗和改姓恢复祖姓的过程中，建议咨询专业的法律人士，确保所有程序符合法律规定。