黑木耳菌的制作程序主要包括以下几个步骤：
菌种配料
配料比例：锯末（或棉籽壳或秸秆粉）：80斤；麦麸：5-8斤；豆粉：1斤；菇耳壮：0.14斤；石膏：0.8斤。
制备方法：先将锯末称好，再将麦麸、豆粉、石膏干拌均匀，加入菇耳壮（温水化开溶解），与锯末等混合物干拌均匀，加水翻拌3~4遍，使含水量达到65%。
装瓶
将拌好的料闷堆1~2小时后装瓶，使用自制漏斗将料装入葡萄糖注射液瓶子中，再在瓶口中央打孔，并用清水涮净瓶口，塞上棉塞。
灭菌
将装好的瓶子放在常压或高压灭菌锅中灭菌，常压下保持6~8小时，高压下保持1.5~2小时，确保彻底灭菌。
接种
灭菌后，将瓶子趁热取出，放入接种箱内，进行无菌操作接种。接种时，用灼烧过的接种针挑取母种，接入原种培养基的接种孔内，迅速包扎瓶口。
培养
接种后的瓶子冷却至30℃以下，搬入无菌接种箱内，进行恒温培养。培养过程中要每天检查菌丝生长发育情况，及时挑出杂菌。
纯化
在无菌条件下，将没有感染到杂菌的目标菌丝转接到新培养皿中，进行纯化处理，观察提纯效果，一般经过1-2次纯化即可得到目标菌种。
储藏
培养好的菌种应及时下架使用，或放在0-5℃的环境下进行储藏，以保持其活性。
这些步骤确保了黑木耳菌种的顺利制作和高质量生产。建议在操作过程中严格遵循无菌操作规程，以保证菌种的纯净度和生长效果。