小程序每年需要收费的原因主要包括以下几点：
服务器费用：
小程序运行需要服务器支持，而服务器费用通常是按年付费的。
技术升级：
随着微信小程序功能的不断更新，可能需要支付额外的费用来进行技术升级和服务更新。
运营指导：
如果小程序开发公司的员工离职，新员工的培训也需要费用，这通常也被视为每年的运营成本。
域名和SSL证书费用：
小程序需要域名和SSL证书来保证安全访问，这些费用也是按年支付的。
接口费用：
使用第三方服务如短信验证码、支付接口等，通常需要支付相应的费用。
定制开发费用：
如果选择定制开发小程序，第一年的费用会较高，后续每年可能还需要支付维护费用。
认证费用：
微信小程序每年都需要进行认证，认证费用为300元。
年审费用：
对于有特殊需求的商城小程序等，可能还需要支付年审费用。
综上所述，小程序每年需要支付的费用包括服务器、技术升级、运营指导、域名、SSL证书、接口、定制开发、认证和年审等费用。这些费用确保了小程序的正常运营和用户的使用体验。用户在选择小程序开发服务时，应与开发公司明确每年的费用标准和支付方式，以避免后续产生不必要的误解和额外费用。