点餐小程序的劣势主要包括以下几点：
网络依赖性：
使用小程序点餐需要依赖稳定的网络环境。如果网络信号不好或者网络不稳定，可能会影响用户的点餐体验，导致订单无法提交或处理出现延迟。
信息安全性：
小程序点餐涉及到用户的个人信息和支付信息，一旦遭到黑客攻击，可能导致用户个人隐私泄露和资金安全问题。
需要手机支持：
小程序点餐需要用户拥有一部能够运行小程序的手机。对于一些老年人或者没有智能手机的用户来说，使用小程序点餐将存在困难。
平台抽成费用较高：
作为连接消费者和商家的第三方平台，点餐微信小程序会根据订单金额收取一定比例的佣金。对于商家而言，这无疑增加了运营成本，减少了利润空间。
商家和骑手的压力较大：
由于点餐微信小程序平台的竞争激烈，商家需要投入更多的精力和时间来维护自己的店铺和订单。同时，骑手也面临着送餐时间紧张、订单量大等问题，这容易导致送错、漏送等问题的出现。
配送问题：
在配送过程中，由于受到交通拥堵、恶劣天气等因素的影响，送餐时间可能会出现延误。这不仅会影响消费者的用餐体验，也可能会引发消费者对商家的投诉和差评。
食品安全问题：
虽然平台对商家的审核在一定程度上可以保证商家的合法性和资质，但并不能完全保证商家的食品安全。一些不良商家可能会利用平台漏洞进行欺诈行为，如使用过期食材、以次充好等，这会对消费者的健康造成潜在威胁。
功能限制：
部分餐饮小程序的功能不全面，面对某些行业使用不够灵活。
平台依赖：
依靠微信等平台，有时会受到平台政策的控制，无法成为独立的流量入口。
客户转化率不高：
小程序客户多，容易吸引商圈外的客户来探店，但正因为如此，真正能沉淀下来的忠实客户并不多。
额外费用：
搭建小程序需要额外的费用，店铺营造整体的成本增加。
用户习惯：
尽管扫码点餐为消费者提供了方便，但仍有部分消费者不习惯这种新型的点餐方式。他们可能更倾向于传统的纸质菜单点餐。
信息泄露风险：
扫码点餐需要消费者提供个人信息和支付信息，虽然大部分餐厅都采取了安全措施来保护消费者的信息，但仍有可能出现信息泄露的情况。
技术支持：
开发和维护扫码点餐小程序需要一定的技术实力。对于没有技术实力的餐厅来说，可能需要依赖第三方开发商，这可能会增加开发成本和技术维护成本。
效率低：
传统的点餐方式需要服务员将客人的点餐信息记录下来，然后再将其传达给厨房，这一过程需要花费大量的时间，而扫码点餐则可以节省大量的时间。
容易出错：
传统的点餐方式容易出现服务员记录错误的情况，而扫码点餐则可以减少这种情况的发生。
无法提供实时反馈：
传统的点餐方式无法提供实时反馈，客人无法及时了解订单的状态，而扫码点餐可以提供实时反馈，让客人及时了解订单的状态。
无法提供个性化服务：
传统的点餐方式无法提供个性化服务，而扫码点餐可以根据客人的喜好推荐菜品，提供更好的服务。
综合来看，点餐小程序在带来便利的同时，也存在一些劣势和挑战。商家和消费者在使用时需要注意这些问题，并采取相应的措施来应对和解决。