种猪畜禽的免疫程序需要根据疫病防治、当地疫情、畜群的免疫状态以及饲养管理等实际情况来制定。以下是一个通用的种猪畜禽免疫程序：
使用经国家批准生产或已注册的疫苗 ，并做好疫苗管理，按照疫苗保存条件进行贮存和运输。免疫接种时应按照疫苗产品说明书要求规范操作
，并对废弃物进行无害化处理。
免疫过程中要做好各项消毒，同时要做到“一猪一针头”，防止交叉感染。
具体免疫程序
仔猪免疫程序
20日龄和70日龄： 各肌肉注射一次猪瘟猪肺疫两联苗或在初生未吃初乳前立即接种一次。 断乳时（30-35日龄）
断乳时（30-35日龄）：口服或肌肉注射一次仔猪副伤寒疫苗。
7-15日龄：右侧胸腔注射一次猪喘气病疫苗。
60日龄：肌肉注射一次猪口蹄疫O型灭活疫苗。
70日龄：肌肉注射一次猪传染性萎缩性鼻炎疫苗。
成年母猪免疫程序
春秋两季各注射一次猪瘟疫苗和猪瘟二联苗，剂量是：猪瘟3头份，猪瘟三联苗2头份。
秋季注射一次口蹄疫疫苗，如果是疫区，2个月后应加强免疫一次。
后备母猪配种前1~1.5个月：注射猪细小病毒疫苗。
怀孕母猪产前40天、15天：各注射一次大肠杆菌疫苗。如果在冬季产前30天注射猪传染性胃肠炎一病毒性腹泻两炼苗。
种公猪免疫程序
春秋两季各注射一次猪瘟疫苗和猪瘟二联苗，剂量是：猪瘟3头份，猪瘟三联苗2头份。
秋季注射一次口蹄疫疫苗，如果是疫区，2个月后应加强免疫一次。
注意事项
制定免疫程序时应考虑当地疫病情况，不可死搬硬套。
接种前后如有病猪或治疗中猪只，痊愈后及时补免。
注射器吸取疫苗前，须充分振荡，使疫苗与佐剂混合均匀。
严格按照疫苗说明书的接种部位、剂量和保存方法进行。
以上免疫程序仅供参考，具体实施时应结合实际情况进行调整和优化。