船舶的应变程序主要包括以下几个方面：
船舶遭遇恶劣天气/自然灾害的应急预案
发出警报，组织应急并及时抄收当地或附近气象台的天气预报。
迅速报告公司指定人员或其替代人员及公司调度室，并根据船位，报告就近港口当局或海上搜救中心。
根据天气预报或气象传真图，综合分析天气情况，作出判断。及时调整航向、航速，以减轻恶劣天气对船舶的损害。必要时择就近安全港口避难。
轮机长应在机舱指挥轮机员工作，保证主、辅机的工作状态正常，确保舵机的安全使用。并做好应急舵的随时转换使用。按船长指令，安排轮机员驳油，将燃油集中，减少不满舱，减少自由液面，保持船舶良好稳性。
大副听从船长命令，协助船长工作，并通知机舱做好排水系统的使用准备工作，确保排水系统正常使用。
火灾应急预案
报警：火灾发现、报警、值班人员行动、全船示警。
集合：到达现场集合，清点人数。
防护：火场周围消防水冷却。
调查：探火调查并救出一名伤员、手提灭火器扑救无效。
扑救：水带组进火场灭火，火势太大，无法扑灭，准备施放固定术灭火系统。
集合：撤离人员并清点人数。
整理：清理火场，设备归位。
碰撞应急预案
报告：测爆发生碰撞后，驾驶台应立即报告船长和通知机舱。
报警：如碰撞造成油污、火灾、人落水等，应立即发出油污、消防、人落水等应急警报信号。有关船员应根据发出的警报信号，按应变部署表中规定的分工和职责，携带指定的器材到现场参加应急。
判明损害情况：大副应在现场指挥有关人员做连续测量和记录；木匠观察淡水舱、污水沟（井）、双层底压载舱、干隔舱等有无进水以及水位变化情况；机舱有关人员测量各油舱（柜）的液位变化情况；水手长带领水手测量测爆周围水深，尤其是船首尾的水深变化情况。
救助：在不严重危及自身安全的情况下，根据船长指示救助对方船上的船员及旅客，并设法尽量减轻对方船舶因碰撞而造成的损失。
弃船：如本船有沉没危险，根据船长的命令迅速发出求救信号，并做好弃船准备。
搁浅/触礁应急预案
报告：航行中，船舶发生触礁或搁浅后，值班驾驶员应立即停车，并报告船长和通知机舱。
报警：如因触礁、搁浅造成油污、人落水等，应立即发出油污、人落水等应急报警信号。有关船员应根据发出的警报信号，按应变部署表中规定的分工和职责，携带指定的器材到现场参加应急。
船长应督促大副和轮机长查明破损部位损坏情况，有无进水、人员伤亡、油污染情况及程度，木匠应立即测量各污水沟、压载舱和淡水舱液位，二管轮应立即测量油舱液位，大副应派专人监督破损部位，及时向船长报告监测结果。
其他应急程序
船舶应急的组织与准备：包括消防、救生（包括弃船和人落水）以及油污应急等。
熟悉船舶应变部署：船员应熟悉各种紧急情况下的应变部署，包括应变部署表/应急计划的基本知识。
这些应急程序旨在确保在船舶发生各种意外事故和紧急情况时，能够迅速、有效地进行应对，以减少事故损失，并保障船舶和人员的安全。