搜查的合法程序包括以下几点：
出示搜查证
进行搜查时，必须向被搜查人出示搜查证，除非在执行逮捕、拘留时遇到紧急情况，才可以无证进行搜查。
要求见证人在场
搜查时应当有被搜查人或者他的家属、邻居或者其他见证人在场。
女工作人员搜查妇女身体
搜查妇女的身体，应当由女工作人员进行。
制作搜查笔录
搜查的情况应当写成笔录，由侦查人员和被搜查人或者他的家属、邻居或者其他见证人签名或者盖章。
紧急情况下的无证搜查
在执行逮捕、拘留时，如遇紧急情况，可以无证进行搜查，但应当在笔录上注明符合上述规定的搜查。
搜查权的限制
搜查只能由公安机关或者人民检察院的侦查人员进行，其他任何机关、单位和个人都无权对公民人身和住宅进行搜查。
搜查对象和地点
搜查的对象包括犯罪嫌疑人以及可能隐藏罪犯或者证据的人的身体、物品、住处和其他有关的地点。
法律依据
搜查的法律依据主要包括《中华人民共和国刑法》第一百三十六条、《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百三十八条至第一百三十九条等。
这些程序旨在保障搜查行为的合法性和透明性，防止非法搜查的发生，并确保被搜查人的合法权益不受侵犯。