国有土地使用权注销登记程序主要包括以下步骤：
变更土地登记申请
国有土地使用权终止时，使用权人应持国有土地使用证及有关准予注销的批文或证明文件，向土地行政主管部门提出注销土地登记申请。
权属审核
土地行政主管部门对申请人的资格和提供的文件进行审核，确认土地权属的合法性和注销的合理性。
退出登录登记
审核通过后，土地行政主管部门将办理注销手续，收回国有土地使用证，并发布收回国有土地使用权公告。
收回决定书
根据市或县级人民政府批准的收回国有土地使用权方案，土地行政主管部门应向原土地使用权人下达《收回国有土地使用权决定书》，并告知其申请复议和提起诉讼的权利。
补偿
对于被收回的土地，如果已经设定抵押，需要由抵押人与抵押权人协商解除抵押合同，并向登记机关办理注销抵押登记手续。同时，对于土地使用权被收回的补偿问题，应按照相关规定进行。
申请文件
申请注销土地登记时，申请人应提供书面申请和土地登记申请书、个人身份证复印件（验原件）、企业工商营业执照、组织机构代码复印件等文件。
听证
如果土地使用权人要求听证，应在接到收回国有土地使用权通知后的一定期限内向土地行政主管部门提出，土地行政主管部门应组织听证。
报批
土地行政主管部门在组织听证后，将拟订的收回国有土地使用权方案连同听证结果报市或县级人民政府审批。
公告
收回国有土地使用权后，土地行政主管部门应发布收回公告，通知公众。
办理注销登记
原登记发证机关在接到《收回国有土地使用权决定书》后，将办理注销土地登记，收回国有土地使用证。
以上步骤完成后，国有土地使用权注销登记程序即告完成。建议在办理注销登记时，所有相关文件和手续都应严格按照相关法律法规和程序进行，以确保注销过程的合法性和有效性。